Bariloche Oct. 7 – 11
Main Location
- Centro Regional Universitario Bariloche
- Quintral 1250 – CRUB-UNCOMA
- Teléfonos: +54 294 442 3374 / 6368 / 8505 / 2111
Alternative Location
- Centro Científico Tecnológico CONICET Patagonia Norte
- Av. de Los Pioneros 2350 – CCT-CONICET
- Teléfonos: +54 294 444 2676 / 2382 / 2088
Postcard location on the banks of Lake Nahuel Huapi 
Centro Regional Universitario Bariloche (CRUB) 
Centro Científico Tecnológico Patagonia Norte (CCT)
Fundamentación: A medida que entramos en la “era post-genómica”, los métodos de generación de perfiles de expresión “a nivel de genoma” a nivel del transcriptoma y el proteoma han pasado a primer plano. Si bien en los últimos años ha habido un tremendo impulso para desarrollar tecnología analítica y bases de datos para la ‘transcriptómica’ y la ‘proteómica’, aún no ha surgido una estrategia de análisis integrador para estos datos ómicos. El objetivo principal del curso es proporcionar herramientas para superar este obstáculo y permitir a los estudiantes enfocarse verdaderamente en los aspectos integradores del “fenotipo” del organismo.
Objetivos: Se capacitará a los alumnos en manejo y análisis de datos genómicos transcriptómicos y proteómicos de manera integrada. Se capacitará a los alumnos en la obtención e interpretación de resultados producto de análisis x-ómicos. Al finalizar el curso el alumno va a estar capacitado para manejar distintos programas de análisis de BigData y va a poder interpretar los resultados producidos, como los publicados, para responder objetivos específicos de su investigación.
Faculty
| Dr. Mark Blaxter (ED.AC.UK) | Dr. Guillermo Daniel Alonso (UBA) | Dra. Carolina Bagnato (UNRN) |
| Dra. Laura Kamenetzky (UBA) | Dr. Lucas Maldonado (UBA) | Dr. Nathan Charles Medd (ED.AC.UK) |
| Dra. Gisela Franchini (UNLP) | Dr. Gabriel Lichtenstein (UBA) | Dr. Pablo Manuel González de la Rosa (ED.AC.UK) |
Schedules
Pre-Course training session in Linux and R
- Usuarios y Nodos Asignados a cada alumno
- ¿Cómo conectarse al clúster para realizar los trabajos prácticos?
- Introducción a Linux (bash) y a R con Evaluación (deadline 3 de octubre)
Workshop Guides / Guías de Trabajo Práctico
- Day 2 – Genome Assembly
- Day 3 – Structural Gene Annotation
- Day 4 – Intro to Genomics in R
- Day 4 – Genome Visualization in R
- Day 5 – Intro to Comparative Genomics
- Annex – Functional Annotation (Molecular & Biological)
- Annex2 – BlobToolKit for genome assembly QC
Data Sets
- Lucas Data Set – GP_2019.tar.gz (1 GB in size)
- Nathan Data Set – Genomics_in_R.tar.gz (52 MB in size)
- Nathan Follow up Material – Cloud Drive
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