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Conectarse al Nodo Bioinfo

Desde Linux o macOS

Para conectarse al nodo bioinfo abrir una terminal (Bash) e iniciar sesión en el clúster usando el protocolo de conexión SSH mediante el comando:

ssh -X túNombreDeAcceso@bioinfo.fmed.uba.ar

Ingrese su password.

NOTA: en macOS precisará además instalar el Xquartz si quiere usar aplicaciones con entorno gráfico desde el clúster, sino puede iniciar una sesión ssh pero sin usar el parámetro -X.


Desde Microsoft Windows

Precisará de un programa para realizar una conexión remota mediante el protocolo SSH. Podrá optar entre varias opciones según la necesidad que tenga y los recursos de los que disponga su PC.

Programas Recomendados:

  1. Oracle VM VirtualBox con Linux
  2. MobaXterm Home Edition
  3. PuTTY
  4. Extensión para Google Chrome: Secure Shell

En mi caso particular, me instalé una máquina virtual usando Oracle VirtualBox y me descargue un sistema operativo Linux en mi notebook (una intel i5 de 64 bit con 8 GB de RAM), en la cual tengo instalado Windows 10, así que ahora inicio mi Oracle VM VirtualBox con Linux dentro de Windows, abro una terminal Bash y me conecto con el comando:

 ssh -X túNombreDeAcceso@bioinfo.fmed.uba.ar


Pero si tu notebook o PC no tiene tantos recursos de memoria y procesador puede instalar un programa emulador de Linux en Windows sin necesidad de instalar una máquina virtual completa. 

Para ello puede optar en descargar el MobaXterm Home Edition (recomendado) o el clásico PuTTY ssh.

Por otro lado, si prefiere algo más minimalista y es usuario de Google Chrome, puede instalar una extensión en su navegador (4), configurarla con los datos necesarios (leer abajo) y se conectará en una tab de chrome.

Sea cual fuere deberá configurar el programa con los datos necesarios para conectarse al clúster y estos son:

  • host: bioinfo.fmed.uba.ar
  • port: 22
  • username: túNombreDeAcceso
  • password: *********

Ejemplos:

Figura 1: Nueva sesión del mobaxterm configurada con los parámetros del clúster (host, username & port).
Figura 2: Nueva sesión del puTTY configurada con los parámetros del clúster (host & port).

PowerLine y PowerLine Fonts

En el clúster la terminal de bash cuenta con una customización llamada PowerLine, que permite visualizar de forma más amena el prompt de bash, es decir, la línea que espera los comandos del usuario. A veces, dependiendo del OS (Windows, Mac o Linux) los símbolos de PowerLine no se ven de forma correcta. Esto se puede solucionar instalando un paquete de Fuentes compatible con PowerLine, en este caso, se sugiere instalar en su OS la fuente Fantasque Sans Mono (descargar aquí). Con tan solo descomprimir el archivo zip y ejecutar los archivos OTF (OpenType font) se podrán instalar en su sistema. Luego debe cambiar la fuente ya sea en Moba, en la terminal Linux o en la terminal mac yendo a propiedades y eligiendo la fuente recien instalada.