Opción A) Solicite asistencia
Complete con sus datos el formulario de solicitud y seleccione la opción “Programa Nuevo” en el sitio:
https://bioinfo.fmed.uba.ar/solicitudes/
Describa brevemente el programa que precisa y adjunte un link a la página de descarga, el paper o la guía de instalación.
Debe saber que por lo general no disponemos de fondos para adquirir licencias comerciales por lo que utilizamos softwares open-source.
Por último, es altamente recomendable que ya sepa usar la herramienta que solicita o que haya leído algún tutorial antes de solicitar su instalación para correrla en el clúster. Cualquier duda no dude en escribirnos.
Aquí hay 5 sugerencias para redactar un correo ameno: https://genuinocloud.com/tutoriales/como-redactar-un-correo-formal/
Opción B) Hágalo usted
Aprovechando las funciones del gestor de paquetes de anaconda, podrá instalar en su carpeta home herramientas que estén en el repositorio bioconda (https://anaconda.org/bioconda/).
Primero debe crear un environment para la herramienta que quiere instalar y luego podrá instalarla en el mismo. El punto desfavorable es que de esta manera la herramienta sólo podrá ser utilizada por usted y no por el resto de los users, además de que será su responsabilidad no afectar el sistema operativo y programar la herramienta y sus dependencias, como así el armado del script de slurm. Por otro lado, de esta manera se independiza de la agenda de los administradores y puede ser más dinámico y educativo que usted se instale la herramienta por su cuenta.
Ejemplo:
Quiero instalarme la herramienta Star-Fusion y encontré que estaba disponible en el repositorio bioconda:
https://anaconda.org/bioconda/star-fusion
Antes que nada lo primero que voy a hacer es crearle un environment en mi home, por ejemplo:
conda create -n star-fusion
Luego voy a activar el environment que acabo de crear:
conda activate star-fusion
Una vez que estoy dentro del environment recien ahí puedo escribir el comando de instalación que figuraba en el sitio de bioconda, es decir:
conda install -c bioconda star-fusion
Por último pruebo que la herramienta funcione, por ejemplo, en este caso, escribo:
STAR-Fusion --help